При екскреторній урографії основними протипоказаннями є алергія на йод і фактори ризику контрастною нефропатії.

Екскреторна урографія раніше застосовувалася як самостійний метод дослідження. Сьогодні її з успіхом замінюють МСКТ з контрастрованием, а також МРТ нирок і сечових шляхів. Додаткові рентгенівські знімки через 12 і 24 год бувають показові обструктивних процесах у верхніх сечових шляхах при постпочечной обструкції або гідронефрозі.